Berikut jadwal lengkap babak penyisihan Piala Menpora:
Grup A (Stadion Manahan, Solo)
21 Maret 2021
15.15 WIB - Arema FC Vs Tira Persikabo
18.15 WIB - PSIS Semarang Vs Barito Putera
25 Maret 2021
15.15 WIB - Tira Persikabo Vs PSIS Semarang
18.15 WIB - Barito Putera Vs Arema FC
30 Maret 2021
15.15 WIB - Barito Putera Vs Tira Persikabo
18.15 WIB - Arema FC Vs PSIS Semarang
Grup B (Stadion Kanjuruhan, Kabupaten Malang)
22 Maret 2021
15.15 WIB - Bhayangkara Solo FC Vs Borneo FC Samarinda
18.15 WIB - Persija Jakarta Vs PSM Makassar
27 Maret 2021
PSM Makassar Vs Bhayangkara Solo FC Pukul 15.15 WIB
Borneo FC Samarinda Vs Persija Jakarta Pukul 18.15 WIB
31 Maret 2021
15.15 WIB - Borneo FC Samarinda Vs PSM Makassar
18.15 WIB - Persija Jakarta Vs Bhayangkara Solo FC
Grup C (Stadion Si Jalak Harupat, Kabupaten Bandung)
23 Maret 2021
15.15 WIB - Madura United Vs PSS Sleman
18.15 WIB - Persebaya Surabaya Vs Persik Kediri
28 Maret 2021
15.15 WIB - PSS Sleman Vs Persela Lamongan
18.15 WIB - Madura United FC Vs Persebaya Surabaya
1 April 2021
15.15 WIB - Persik Kediri Vs PSS Sleman
18.15 WIB - Persela Lamongan Vs Madura United
3 April 2021
15.15 WIB - Persik Kediri Vs Madura United
18.15 WIB - Persebaya Surabaya Vs Persela Lamongan
7 April 2021
15.15 WIB - Persela Lamongan Vs Persik Kediri
18.15 WIB - PSS Sleman Vs Persebaya Surabaya
Grup D di Stadion Maguwoharjo, Sleman
24 Maret 2021
15.15 WIB - Persiraja Banda Aceh Vs Persita Tangerang
18.15 WIB - Persib Bandung Vs Bali United
29 Maret 2021
15.15 WIB - Bali United Vs Persiraja Banda Aceh
18.15 WIB - Persita Tangerang Vs Persib Bandung Pukul
2 April 2021
15.15 WIB - Persita Tangerang Vs Bali United
18.15 WIB - Persib Bandung Vs Persiraja Banda Aceh
Dari setiap grup nantinya akan diambil dua peringkat tertinggi untuk masuk ke babak perempat final yang rencananya digelar pada 9-12 April 2021. Babak perempat final akan menggunakan format gugur satu pertandingan.
Juara dari Grup A nantinya akan menghadapi peringkat kedua Grup B sementara Juara Grup B akan bertemu peringkat kedua Grup A. Juara Grup C akan bertemu dengan peringkat kedua Grup D dan sebaliknya.
Terjadi perubahan format untuk babak semifinal dan final. Sebelumnya laga akan digelar dengan hanya satu pertandingan tetapi belakangan diubah menjadi dua pertandingan. Laga semifinal akan digelar pada 15 - 19 April sementara babak final akan digelar pada 22 dan 25 April.
PSSI dan PT LIB memastikan seluruh laga Piala Menpora 2021 tak akan dihadiri penonton. Setiap pemain, pelatih, perangkat tim hingga perangkat pertandingan juga harus menjalani isolasi ketat yang merupakan bagian dari protokol kesehatan Covid-19 yang telah disiapkan.